福建省石門澳港口建設發展有限公司于2016年3月9日注冊成立，公司注冊資本金38380萬元。公司經營范圍包括對港口碼頭、港航基礎設施、倉儲業的投資、建設、開發、經營，貨物裝卸、倉儲、中轉服務，物流配送，多式聯運。公司主要開發項目為秀嶼港區石門澳作業區6#、9#、11#泊位工程，總投資30.7億元。